机电技术系开设五年制高职机电一体化技术、智能控制技术、工业互联网应用三个专业。该系拥有国家中等职业教育改革发展示范学校重点专业、江苏省优质专业、省职业教育高水平示范性实训基地、市职业教育现代学徒制试点专业建设研究基地、南通市产教融合示范专业、南通市双元育人示范专业、南通市职业院校校企双元育人成效明显项目、江苏联院首批五年制高职高水平专业群、江苏联院首批高水平产业学院、江苏联院智能控制专业建设指导委员会“先进工作单位”等荣誉，多门课程获评“十四五”江苏省职业教育在线精品课程。近几年，师生参加技能大赛获得国赛金牌2枚、银牌2枚，省赛金牌32枚、银牌46枚；参加创新创业大赛获得省赛2金5银。该系坚持校企双元育人，与全国500强企业中天科技集团成立智能制造产业学院，与中天科技、恒科、中科仪、大生集团、施特万等中外知名企业组建现代学徒制班，校企融合，共同培养高素质应用型技术技能人才。